ROS1定义
ROS1(c-ros oncogene1)基因定位于6q22染色体6长臂ROS1称之为'孤儿'受体暴动并无已知ligand基因蛋白质产品是胰岛素受体家族成员,与ALK相关ROS1下游电讯启动STAT3PI3Kinace
ROS1的生理函数不清晰,但从分解学上看,下游效果似似相似于ALK或EGFR反源激活作用
ROS1NSCLC异常
ROS1排列首例肺部肿瘤实际上是HCC78非小细胞肺癌细胞线,但不久后出现大量实际肺部肿瘤样本报告重排列期间ROS1基因断点通常发生于exons32、34或35ROS13碎片组成聚合基因内含暴动域,并有多个伙伴基因描述于肺癌ROS1聚变中,包括CD74、SLC34A2、TMP3、SDC4、EZR、LRIG3、FIG2、 KDELR2和CCDC6聚变基因导出聚变电流激活 驱动传导效果多数这些伙伴涉及重排列与其他染色体,但偶发伙伴则涉及染色体6内反演这可能是ROS1重排列肿瘤中现场混合发现高度可变性的部分原因,包括广隔3'5信号和多发数个单信号发现常因肿瘤而异寄生性聚变已经在动物模型中证明
ROS1重排列肿瘤流行病学与ALK基因重排列NSCC非常相似非选取群从0.6%到3%以上报告流行程度,但数据因分母细胞类型变异而略为混淆部分报告指NSCLC而没有说明测试人群中安地卡菌的比例,而在另一些报告则只测试安地卡菌似似有似有似有似有似有似介于1-2%极偶发报告ROS1混入quous细胞恶性肿瘤可能是虚伪或反映异常临床环境(从不吸烟)。ROS1聚积法从不吸烟者比较常见并往往在较年轻的病人中发现可能以女性为主,但东亚和高加索人口似乎也有相似流行率
和ALK重排列和EGFR变异一样,ROS1聚变是一种上瘾寄生驱动器,它与肺外膜生成相联(终端呼吸元件)与烟草驱动致癌无关绝大多数报告案例都安眠药这些案件的原理可变性相当大似乎有超固态或直方模式肿瘤,标志圈细胞偶而发现,有些研究报告差分性强、多态肿瘤或扰动肿瘤,但并不存在可依赖的生理模式来优先选择测试对象
ROS1预测生物标志
迄今尚没有固定数据显示在临床或治疗响应方面有任何差异Crizotinib介于报告的不同聚变蛋白有限临床数据表明ROS1重排对crizitinib反应性很强,报告响应率超过70%Crizotinib现由美国食品药管局批准处理ROS1重排列NSCC主动抗ROS1重排列肿瘤的其他代理物,例如inctib,PF-06463922(loratinib)尚处于初级开发阶段
测试方法
ROS1测试常用核心方法拆分FISH解析,尽管基于所有上述理由,测试尚不普及和主流化,至少在欧洲内部分解基因mRNA基因产品可用逆转转录子聚合链反射法解析和大规模并行排序法方法识别脱氧核糖核酸聚合基因ROS1聚合基因与聚变基因蛋白质产值提高相关联蛋白质可以通过免疫史化学检测
FISH使用双色分解探针测试可能是最易获取的ROS1重排列NSCCLCrizotinib获得欧洲药品局许可前,欧盟药物使用测试需求仍将未知作为一项标准方法,FISH测试通常需要至少50个可评估细胞上最小读取量,理想由两个不同的阅读器读取如上所述,ROS1聚变基因通常涉及染色体间重新排列,而不是染色体内倒置结果分形信号通常相当清晰阅读比ALK解析容易得多多数实验室接受10%最小异常细胞测试异常细胞在同一肿瘤中可能显示一系列异常信号模式聚变覆盖也有一些差异,可用各种商业检测集检测,在考虑解析时应记住这一点。
RT-PCR技术非常特殊,但缺乏敏感度和可靠性稀有聚变基因,如果多式PCR响应素集不覆盖相关聚变基因,质量mRNA可能无法从stime固定嵌入组织中获取,而mRNA通常是肺癌诊断素源技术不广可用,需要特殊知识
新文献用免疫史化学检测NSCL样本中的ROS1蛋白大体上是为了希望筛选方法,如许多ALK测试中心使用的方法,可被视为检测异常分子的有效方法FISH测试被视为相对昂贵和耗时作为一种筛选工具初始报告描述IHC与FISH实战性之间的密切关联后期研究与传闻经验混合显示ALKIHC与FISH可能无法使用现有试剂对ROS1IHC和FISH产生同等程度的密切关联问题似乎是IHC阳性高发率问题,而FISH没有证实这一点,被非图象等非图状细胞群中自然染色和阳性等数方面混淆低阈值命令确认FISH测试似乎是适当的测试方法
使用NGS方法检测聚合基因是可行的,虽然例行临床环境没有广泛实践,但使用量肯定在增加毋庸置疑,随着技术经验的提高,这一方法将得到广泛采用。ROS1通常是NGS平台上商业可用测试板覆盖的聚合基因测试是否被接受为初级诊断或筛选工具,需要FISH、RT-PCR或IHC确认,还有待观察
ROS1NSCLC测试
多数现有指南不强推荐ROS1重排列测试这是因为Crizotinib药物迄今大都用于ROS1重排列案例,但并没有得到普遍批准和报销使用费或通过临床试验或某种特殊获取机制获取该药时,可考虑测试如果情况如此,则临床参数-吸烟习惯、性别、年龄、民族等-一般不应用来选择测试对象排除吸烟者并发恶性肿瘤可能冒 ROS1聚合病人失踪的风险
当前Crizotinib使用二线或大线和稀有聚变问题加获取药物问题意味着ROS1聚变基因的例行反射测试异常药检和访问量增加后,这可能改变ROS1测试证明对驱动分子变换为负值后才考虑ROS1测试,如EGFR或KRAS变异或BRAF变异和ALK基因重排列筛选组类ROS1重排列报告将流行率提高至7-12%或以上筛检可限为三倍或四倍负肿瘤,
下一代测序法的引入将检测ROS1聚合基因将改变测试法在这种假设中,ROS1聚变为NGS屏幕覆盖的多路变异和聚变基因板的一部分ROS1聚合数据将作为NGS数据输出的一部分提供,而不论肿瘤学家是否具体请求提供
样本测试
含有肿瘤细胞的病理样本可用于ROS1测试:生物采样、细胞素材、外切肿瘤FISH样本需要最小数可评估肿瘤细胞,RT-PCR和NGS技术取决于mRNA或DNA质量和数量,ROS1IHC可读取极小数格然而,IHC测试数据有限,部分已知假阳性染色反应可能使得对极小数肿瘤细胞的积极调用不智视IHC技术使用而定,病理学家必须知道测试的陷阱,正如他们在阅读FISH测试时必须知道的那样,以避免假正或假负结果以当前知识状态,有必要用FISH测试或其他可靠技术确认任何正IHC测试
确保及时质量ROS1测试
工作链中有许多步骤和个人从决定测试到采样处理、提交分子实验室、分子和病理数据同化并报告治疗师IHC可数小时执行阅读-同日服务可能可行,次日服务相当例行性FISH测试通常需要更长时间当前NGS测试结果需要多日验证高效通信和工作系统对及时诊断至关重要目前,这些可能无关性问题,而crizitinib提供和批准有限ROS1测试成为例例时 所有常用因素将变得更加重要
所有发布临床报告实验室应参与外部质量保证程序并适当执行内部定期监控性能,了解潜在的假正假负测试很重要
ROS1报告测试结果
ROS1测试结果应结合样本报告,样本诊断出NSCLC并融入总体病理报告上下文至关紧要,避免错误解读结果需要专家病理学输入FISH测试评估,因为识别肿瘤细胞有难度
提交治疗医生的报告应提供ROS1测试方法细节,在FISH测试中,评估细胞数和显示异常%泛泛评论任何结果对治疗的影响是可以接受的,但应避免提出具体的治疗建议。
引用
里科娃库尔et al.磷信号带全球调查辨识肺癌成因动脉手机2007131 1190-1203.
KerrKMBENDORVLEDERMJet al.EMSO第二次肺癌共识会议:非小细胞肺癌病理学和分子生物标志安安科尔2014年25 1681-90
